副主任科员和副科级干部的区别在：副主任科员职务层次为非领导职务的副科级干部，而“副科级干部”则包括副科级职务层次的非领导职务干部和领导职务的干部两类。副主任科员是中国公务员职务的一种，其属于综合管理类非领导职务序列，副主任科员的级别相当于领导职务的副科长（副乡长、副镇长）。2018年12月29日，全国人大常委会审议通过了《中华人民共和国公务员法（修订草案）》，“副主任科员”这一职务已成为历史。乡科级副职是指一个公务员级别，主要岗位是乡（镇）党委、人大、政协副职，级别是二十四级至十七级，职位的法律依据是《中华人民共和国公务员法》。乡科级副职包含各地市（设区）党委、人大、政府、政协下属单位所属科室的副职以及民主党派副职，各县市党委、人大、政府、政协下属单位所属科室的副职和法院、检察院的下属单位所属科室的正职以及民主党派副职，各乡（镇）党委、人大、政府、政协的副职和法庭、检察室正职。