清除草缸绿藻，可以采用人工去除、药剂去除和生物去除的方法，人工清除绿藻时，需要用牙刷将草缸玻璃壁上的附着藻类刷掉，而使用药剂清除绿藻时，可以往草缸中滴加稀释后的灭藻药物，使草缸中的绿藻全部死亡。

1、人工去除

人工清除草缸中的绿藻时，需要准备一把牙刷或者玻璃刷，将附着上草缸玻璃壁上的藻类全部刷掉，而且要准备一把锋利的剪刀，将草缸中附着有绿藻的水草给剪掉，操作时需要小心，以免伤害到了草缸中的鱼虾。

2、药剂去除

使用药剂清除绿藻时，需要在专业的花店中购买去除藻类的药物，再往草缸中滴加几滴药剂，使草缸中的绿藻快速死亡，在选择药物时需要谨慎，因为市面上大部分去除藻类的药物都对水草和小鱼虾有害。

3、生物去除

采用生物去除绿藻法时，可以在草缸中投放一些鱼类，例如青苔鼠，青苔鼠可以啃食草缸玻璃壁上的绿藻，或者在草缸中投放黑壳虾、大河沼虾或者苹果螺，其中苹果螺会啃食绿藻。