黄芪与红芪不是同一种药。

首先是来源不同，黄芪与红芪是同科不同属的植物。黄芪，又称黄耆，来源于豆科植物蒙古黄芪Astragalusmembranaceus(Fisch.)Bge.var.mongholicus(Bge.)Hsiao或膜荚黄芪Astragalusmembranaceus(Fisch.)Bge．的干燥根。而红芪，又名红皮芪，来源于豆科植物多序岩黄芪HedysarumpolybotrysHandMazz．的干燥根。

其次是外观性状不同。外观性状的区别主要表现在根外皮的颜色，黄芪外表面淡棕黄色或淡棕褐色，而红芪外表面为灰红棕色。再者是产地不同。黄芪的主产地较多，如内蒙古、山西、甘肃、河北等，而红芪仅主产于甘肃。正因为有以上诸多不同，《中华人民共和国药典》（参考2010年版）将其作为2种药材，即黄芪、红芪分别收载。