玉米多穗的原因是遗传因素、顶端雄花序生长受抑制、碳、氮代谢不协调、不合理的种植方式等。有的品种在适宜条件下多个腋芽均同步分化发育易形成多穗，有的品种则腋芽分化发育优势明显，从而抑制下一节果穗发育进程，不形成多穗。

拔节后玉米进入营养生长和生殖生长旺盛期，茎叶生长量大，雌雄穗分化形成，干物质积累迅速增加。此时如果土壤肥沃，水肥过多，会造成碳、氮代谢不协调，影响糖类等矿物质向果穗运输与积累，过多的营养物质会促使多个雌穗花序发育成熟而形成多穗。