核酸探针是指带有标记物的已知序列的核酸片段，它能和与其互补的核酸序列杂交，形成双链，所以可用于待测核酸样品中特定基因序列的检测。每一种病原体都具有独特的核酸片段。

核酸探针法原理是碱基配对，利用核酸探针测定跟踪。互补的两条核酸单链通过退火形成双链，这一过程称为核酸杂交。

化学及生物学意义上的探针，是指与特定的靶分子发生特异性相互作用，并可被特殊的方法探知的分子。抗体-抗原、生物素-抗生物素蛋白、生长因子-受体的相互作用都可以看作是探针与靶分子的相互作用。