1、产地不同：祁门红茶分为三域，由溶口直上到侯潭转往祁西历口，由闪里、箬坑特到渚口，由塔坊直至祁红转出倒湖。滇红主产区位于滇西南澜沧江以西，怒江以东的高山峡谷区，包括凤庆、勐海、临沧、双江等县。

2、制作工艺不同：祁门红茶采制工艺精细，采摘一芽二、三叶的芽叶作原料，经过萎凋、揉捻、发酵，使芽叶由绿色变成紫铜红色，香气透发，然后进行文火烘焙至干。红毛茶制成后，还须进行精制，精制工序复杂花工夫。滇红采用优良的云南大叶种茶树鲜叶，先经萎凋、揉捻或揉切、发酵、烘烤等工序制成成品茶，再加工制成滇红工夫茶，又经揉切制成滇红碎茶。

3、口感味道不同：祁门红茶条索紧细秀长，汤色红艳明亮，特别是其香气酷似果香，又带兰花香，清鲜而且持久。既可单独泡饮，也可加入牛奶调饮。而滇红成品茶条索紧直肥壮，苗锋秀丽完整，金毫多而显露，色泽乌黑油润，汤色红浓透明，滋味浓厚鲜爽，香气高醇持久，叶底红匀明亮。