新买的笛子要用盐水、植物油保养，新买回来的笛子或自己新制作的笛子，如果发现竹质不太干，可将笛子所有洞孔堵塞住，然后灌进点盐水，泡浸1-2天然后打开洞孔将盐水倒出，稍用清水冲洗，待一小时后，再在筒内涂些熟的植物油就可以了。

如果买回来的笛子本来竹质很干而又坚固， 好用酒精擦洗一下笛筒和吹孔的周围，以达消毒之目的。另外竹内的少许水份也会随酒精的挥发而排除。

大家平时在吹完笛子的时候，要把笛子放进笛盒里。一般专业吹笛的人，都有一个笛盒，没有盒的人，可做一个布套， 好做一个宽的，一个窄的，宽的夏天用，窄的冬天用，平日将笛子放在里面。如果这些都没有，可找一块干净的布来包住，以免风吹日晒，灰尘进入。

笛子一般在吹完之后，一定要将笛筒内的口水倒出来。 好做一个布刷，口水倒出后，捅进去轻轻一擦，然后装入盒或袋内。以免口水在笛筒内发霉发臭，以至笛筒腐烂。

笛子吹久了，笛筒内慢慢会有许多灰尘。灰尘加之气水的浸透，久而久之结成了污垢，这不但不卫生，常常发出臭味，甚至要影响音色、音准。大家可以用软布或药棉等，捆缠在木棒上，浸酒精之后擦洗笛子。